MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 chromosome

Total Repeats: 47779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017511	TTAT	2	8	28	35	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017511	AAC	2	6	60	65	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017511	T	6	6	91	96	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017511	A	7	7	107	113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017511	TGG	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017511	A	6	6	247	252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017511	ATTG	2	8	339	346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017511	A	8	8	380	387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017511	TG	3	6	411	416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017511	CTG	3	9	523	531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334896
11	NC_017511	TGCT	2	8	574	581	0 %	50 %	25 %	25 %	385334896
12	NC_017511	GAA	2	6	661	666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334896
13	NC_017511	TGC	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334896
14	NC_017511	CGG	2	6	681	686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334896
15	NC_017511	GC	3	6	735	740	0 %	0 %	50 %	50 %	385334896
16	NC_017511	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334896
17	NC_017511	TAA	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334896
18	NC_017511	TGA	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334897
19	NC_017511	CGC	2	6	930	935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334897
20	NC_017511	CGA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334897
21	NC_017511	CCG	2	6	1001	1006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334897
22	NC_017511	AAT	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334897
23	NC_017511	GCG	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
24	NC_017511	T	7	7	1301	1307	0 %	100 %	0 %	0 %	385334897
25	NC_017511	CGG	2	6	1377	1382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
26	NC_017511	GTT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334897
27	NC_017511	GCA	2	6	1485	1490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334897
28	NC_017511	GCG	2	6	1505	1510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
29	NC_017511	CGG	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
30	NC_017511	GGA	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334897
31	NC_017511	GTT	3	9	1567	1575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334897
32	NC_017511	GCCG	2	8	1581	1588	0 %	0 %	50 %	50 %	385334897
33	NC_017511	T	6	6	1649	1654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017511	CGTGT	2	10	1659	1668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017511	TCTG	2	8	1672	1679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017511	GCG	2	6	1719	1724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017511	GCGG	2	8	1740	1747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017511	TGT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017511	ATG	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334898
40	NC_017511	TGG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334898
41	NC_017511	CGG	3	9	1945	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334898
42	NC_017511	AGG	2	6	1960	1965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334898
43	NC_017511	TGGG	2	8	1980	1987	0 %	25 %	75 %	0 %	385334898
44	NC_017511	GGT	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334898
45	NC_017511	TGA	2	6	2252	2257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334898
46	NC_017511	GGC	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334898
47	NC_017511	CGGG	2	8	2345	2352	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017511	GCG	2	6	2373	2378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017511	TGCC	2	8	2396	2403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017511	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017511	CAG	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
52	NC_017511	GGA	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334899
53	NC_017511	CG	3	6	2533	2538	0 %	0 %	50 %	50 %	385334899
54	NC_017511	CTGG	2	8	2727	2734	0 %	25 %	50 %	25 %	385334899
55	NC_017511	GAC	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
56	NC_017511	GC	3	6	2774	2779	0 %	0 %	50 %	50 %	385334899
57	NC_017511	CGG	2	6	2882	2887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334899
58	NC_017511	CGG	2	6	2933	2938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334899
59	NC_017511	GC	4	8	2975	2982	0 %	0 %	50 %	50 %	385334899
60	NC_017511	TGG	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334899
61	NC_017511	GAC	2	6	3051	3056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
62	NC_017511	T	7	7	3153	3159	0 %	100 %	0 %	0 %	385334900
63	NC_017511	G	6	6	3161	3166	0 %	0 %	100 %	0 %	385334900
64	NC_017511	CGG	2	6	3195	3200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
65	NC_017511	TGGA	2	8	3212	3219	25 %	25 %	50 %	0 %	385334900
66	NC_017511	TGTTT	2	10	3231	3240	0 %	80 %	20 %	0 %	385334900
67	NC_017511	GAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334900
68	NC_017511	GCG	2	6	3266	3271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
69	NC_017511	GGC	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
70	NC_017511	GGTTGA	2	12	3463	3474	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385334900
71	NC_017511	GGC	2	6	3498	3503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017511	GTC	2	6	3551	3556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017511	GGC	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017511	GGC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017511	GCT	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017511	GAC	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017511	CGC	2	6	3780	3785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
78	NC_017511	TTG	2	6	3841	3846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
79	NC_017511	ATG	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
80	NC_017511	GGC	2	6	3932	3937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
81	NC_017511	TGT	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
82	NC_017511	CGG	2	6	3944	3949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
83	NC_017511	GGC	2	6	3960	3965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
84	NC_017511	GGC	2	6	4118	4123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
85	NC_017511	GCCT	2	8	4158	4165	0 %	25 %	25 %	50 %	385334901
86	NC_017511	GCC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
87	NC_017511	TTGG	2	8	4227	4234	0 %	50 %	50 %	0 %	385334901
88	NC_017511	TAG	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
89	NC_017511	CTG	2	6	4271	4276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
90	NC_017511	GTT	2	6	4287	4292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
91	NC_017511	CGG	3	9	4310	4318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
92	NC_017511	TTG	2	6	4369	4374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
93	NC_017511	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
94	NC_017511	TG	3	6	4531	4536	0 %	50 %	50 %	0 %	385334901
95	NC_017511	TGT	2	6	4541	4546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
96	NC_017511	CTGC	2	8	4549	4556	0 %	25 %	25 %	50 %	385334901
97	NC_017511	GCC	2	6	4575	4580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
98	NC_017511	CGG	2	6	4601	4606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
99	NC_017511	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
100	NC_017511	GCC	2	6	4640	4645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
101	NC_017511	GAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
102	NC_017511	ATG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
103	NC_017511	TTG	2	6	4762	4767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
104	NC_017511	GGC	2	6	4902	4907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
105	NC_017511	GCG	2	6	5135	5140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
106	NC_017511	TTTC	2	8	5150	5157	0 %	75 %	0 %	25 %	385334901
107	NC_017511	CTG	2	6	5160	5165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
108	NC_017511	GCC	2	6	5255	5260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
109	NC_017511	CGC	2	6	5267	5272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
110	NC_017511	GGC	2	6	5291	5296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
111	NC_017511	CGGGT	2	10	5398	5407	0 %	20 %	60 %	20 %	385334901
112	NC_017511	CGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
113	NC_017511	GGC	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
114	NC_017511	CG	4	8	5579	5586	0 %	0 %	50 %	50 %	385334901
115	NC_017511	CG	3	6	5604	5609	0 %	0 %	50 %	50 %	385334901
116	NC_017511	GGC	2	6	5627	5632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
117	NC_017511	TTG	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
118	NC_017511	TGA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
119	NC_017511	GTGC	2	8	5760	5767	0 %	25 %	50 %	25 %	385334901
120	NC_017511	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
121	NC_017511	CGG	2	6	5807	5812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
122	NC_017511	GTC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
123	NC_017511	GAAACA	2	12	5863	5874	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385334901
124	NC_017511	GGC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
125	NC_017511	TG	3	6	5948	5953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017511	CTGC	2	8	6081	6088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017511	CGC	2	6	6093	6098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017511	GCT	2	6	6151	6156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017511	CTTC	2	8	6178	6185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017511	GGC	2	6	6202	6207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334902
131	NC_017511	ATCA	2	8	6226	6233	50 %	25 %	0 %	25 %	385334902
132	NC_017511	CAC	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334902
133	NC_017511	AGC	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334902
134	NC_017511	GCC	2	6	6322	6327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334902
135	NC_017511	CGTG	2	8	6387	6394	0 %	25 %	50 %	25 %	385334902
136	NC_017511	TGA	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334902
137	NC_017511	GGC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334902
138	NC_017511	GTTT	2	8	6538	6545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017511	ACT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334903
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142	NC_017511	CG	3	6	6625	6630	0 %	0 %	50 %	50 %	385334903
143	NC_017511	CCGC	2	8	6631	6638	0 %	0 %	25 %	75 %	385334903
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169	NC_017511	GAC	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_017511	ATT	2	6	7704	7709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_017511	GCG	2	6	10922	10927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_017511	TGC	2	6	10986	10991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334906
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275	NC_017511	GCG	2	6	11783	11788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334906
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387	NC_017511	GCA	2	6	16248	16253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_017511	ATA	2	6	16301	16306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_017511	TA	3	6	16305	16310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_017511	T	7	7	16331	16337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_017511	T	6	6	16475	16480	0 %	100 %	0 %	0 %	385334913
392	NC_017511	TGCC	2	8	16502	16509	0 %	25 %	25 %	50 %	385334913
393	NC_017511	GCG	2	6	16623	16628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334913
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